据记者查询，截至9月6日12时，成都双流、成都天府两场已有9个计划进出港航班取消，另外还有多个进出港航班处于延误状态，其中大部分航班为往返广州、深圳的航班。月5日晚到9月6日上午，针对此次台风影响，国航、东航、南航、川航等多家航司相继发布提示信息，公布了9月6日执飞航班取消情况，并宣布了受台风摩羯影响相关航线客票的特处方案。
为保障旅客安全出行，美兰机场将与空管、航空公司等单位严格执行民航局相关规定，在确保各项运行工作符合保障航班安全起降条件后，尽快恢复运行，届时航班计划将由各航司公布。吉祥航空（Juneyao Air）将于12月19日开通墨尔本往返上海的直飞航班，成为第9家运营澳洲航线的中国航司。墨尔本机场的首席执行官Lorie Argus表示：吉祥航空选择墨尔本作为首个澳洲目的地，体现了他们对维州的信心。
根据航司公布的相关航线客票特处方案，对受到台风摩羯影响的航班，航司将向旅客提供免费退改服务。据媒体披露的视频，可以听到飞机在滑行时约莫10秒的时候，突然出现两声爆炸声，飞机左侧引擎附近出现火光。
大风预报：9月7日14时至8日14时，北部湾、南海大部、海南岛沿海、琼州海峡、广东中西部沿海、广西沿海将有6-8级大风，其中广西沿海、海南岛西北部沿海将有9-12级大风，摩羯中心经过的附近海域或地区风力可达13-16级，阵风17级及以上。记者从海口美兰国际机场获悉，受台风摩羯影响，9月7日15时前，各航司在海南控股旗下海口美兰国际机场（以下简称美兰机场）执飞的进出港航班预计全部取消。
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受今年第11号台风摩羯影响，三亚、海口、琼海等机场均发布消息称，9月6日的所有进出港航班取消，深圳机场则宣布称航班可能会受到不同程度的延误影响。
据中央气象台9月5日18时发布台风红色预警，台风摩羯将以每小时15-20公里的速度向西偏北方向移动，强度还将有所增强，将于6日下午至夜间在海南琼海到广东电白一带沿海登陆，最大可能在海南文昌到广东湛江沿海登陆，然后移入北部湾海面，并于7日下午在广西防城港到越南北部一带沿海再次登陆。